Основните цели на Националната програма за контрол и лечение на ротавирусните гастроентерити в Република България 2017-2021 г. са:
1. Чрез специфична профилактика на деца от 6 седмична възраст да се постигне намаляване на общата заболяемост от РГЕ, включително и на тежките му форми, налагащи хоспитализация.
2. Намаляване като цяло на броя на остър гастроентерит в страната чрез създаване на колективен имунитет.
3. Намаляване броя на амбулаторни прегледи и на хоспитализациите във връзка с РГЕ.