Стратегическата цел на програмата е намаляване на заболяемостта и смъртността от кърлежовопреносими инфекции и свеждането им до спорадични случаи в страната, както и постигане на нов, съвременен подход за профилактика и борба с кърлежовопреносимите трансмисивни инфекции за установяване на трайна тенденция за снижаване на заболяемостта и смъртността от КПИ и прогресивно намаляване броя на лицата, ухапани от кърлежи.