Съветът:
1. определя етапите и приоритетите при изпълнението на Националната програма за действие по околна среда и здраве 2008-2013 г., наричана по-нататък „програмата”;
2. одобрява и предлага на Министерския съвет изменения и допълнения на програмата;
3. приема годишните програми и отчети на администрациите - изпълнители на програмата, и дава становище по проектобюджетите им за изпълнението на задачите за следващата година;
4. координира дейността на администрациите за изпълнението на програмата;
5. наблюдава и анализира хода на изпълнението на програмата, като информира Министерския съвет и обществеността;
6. предлага мерки, осигуряващи изпълнението на програмата;
7. представя на Министерския съвет годишен доклад за изпълнението на програмата чрез министъра на здравеопазването и министъра на околната среда и водите.